De film vertelt het waar gebeurde verhaal van Fernando Ramos da Silva, een jongen uit de sloppenwijken die op elfjarige leeftijd plotseling faam verwierf als de misdadige straatjongen Pixote in Hector Babenco's internationale filmsucces Pixote, a lei do mais fraco uit 1981. Quem matou Pixote? verhaalt over de gebeurtenissen hierna. Zijn moeder, die loten verkocht, hoefde niet meer te werken en Fernando kocht een huis voor zijn familie. Toen het geld op was, ging het echter snel bergafwaarts: er ontstond een dramatische vorm van life imitating art. Fernando probeerde jarenlang als acteur aan werk te komen, maar kwam, tegen zijn wil, in een crimineel circuit terecht. In 1987, slechts negentien jaar oud, werd hij in een krot omsingeld door politie. Zijn korte, ogenschijnlijk zinloze leven werd beëindigd met acht directe schoten op het lichaam.Het scenario van de film werd gebaseerd op boeken van José Louzeiro, de auteur die ook aan de basis van Babenco's film stond, en op verhalen van Cida Venâncio Silva, Fernando's weduwe. Centraal in de film staat de realiteit van Brazilië: Fernando's tragische lot is een neerslag van de grote sociale verschillen in het land. De film probeert aan te tonen dat er tegenwoordig vele andere Pixote's zijn, levend op de grens tussen armoede en dood, voor wie misdaad de enige uitweg lijkt. Quem matou Pixote? won alle belangrijke prijzen (beste film, acteur, actrice en scenario) op het afgelopen Gramado Film Festival in Zuid-Brazilië.